Research Group on Natural Computing

Speaker: Prof. Francesc Rosselló Llompart
Head of the Computational Biology and Bioinformatics Research Group
Dept. de Ciències Matemàtiques i Informàtica
Universitat de les Illes Balears

Title: Algunos problemas computacionales en metagenómica

Abstract: El objetivo básico de la metagenómica es estudiar los genomas de toda una comunidad de microorganismos, yendo ``más allá de la genómica'', que se preocupa de analizar el genoma de un organismo individual. Su auge en los últimos diez años ha venido motivado por la invención de tecnologías de secuenciado de ADN más rápidas y más baratas (pero también más bastas) que además se pueden usar para secuenciar el ADN de los microorganismos presentes en una muestra ambiente no cultivada. Las grandes preguntas que se plantea la metagenómica en el análisis de una comunidad microbiana son: ¿qué especies hay?, ¿cuál es la abundancia relativa de cada especie?, y ¿qué características distintivas presenta esta comunidad? La respuesta a estas preguntas pasa por el desarrollo de técnicas de extracción de información significativa a partir de un conjunto enorme (decenas de millones) de secuencias cortas de ADN. El objetivo de esta clase es plantear algunos problemas computacionales motivados por estas preguntas y explicar algunas soluciones provisionales.

Information:

• Date: Monday, 16-06-2014
• Time: 16:30.
• Place: Seminar room H1.50 (First floor, Módulo H, Escuela Técnica Superior de Ingeniería Informática, Universidad de Sevilla)
• Language: Spanish/English

Organized by: Research Group on Natural Computing, and Department of Computer Science and Artificial Intelligence